Данные пропали только в itunes или и на телефоне тоже?
Попробуте восстановится из резервной копии, если это не получится значит восстановить уже скорее всего не выйдет - айтюнс при обновлении снес ваши сохранения..
На будущее рекомендуем пользовться iCloud для сохранения всех ваших данных, это надежнее и вы не будете зависеть ни от iTunes ни от проблем с компьютером.